影片根据真实故事改编，讲述白人医生阿尔佛雷德·布雷拉克（阿伦·瑞克曼 Alan Rickman饰）与黑人合作伙伴维文·托马斯（茅斯·达夫 Mos Def饰）打破种族界限，协力合作开创心脏手术先河，成为心脏外科手术先驱者的故事。医生布雷拉克在事业上雄心勃勃并且眼光独特，他发现了托马斯在医学方面的天赋，开始传授他医学相关的知识。起先托马斯用狗作为实验对象，天分过人的他很快就掌握了医学理论与手术实践上的技艺。他们一起攻克了法洛四联症（又称紫绀婴儿），可他并没有公开托马斯为此做出的贡献。在托马斯因为肤色而遭受不公正待遇的时候，他选择了沉默。 两人亦主亦仆、亦师亦友，在长达三十四年的合作中，维系着这份微妙的友情。当最后托马斯终于受到肯定获奖的时候，他默默的注视着医生布雷拉克的画像，泪流满面。
《上帝创造的东西》讲述了一段长达 34 年的合作关系，始于 1930 年大萧条时期的纳什维尔，当时布莱洛克（艾伦·瑞克曼饰）聘请托马斯（莫斯·达夫饰）在他的范德比尔特大学实验室担任助理，希望他从事清洁工作。但托马斯非凡的手工灵巧性和敏锐的智力出乎了布莱洛克的期望，托马斯很快成为布莱洛克进军心脏外科领域不可或缺的研究伙伴。
影片追溯了 1943 年两人从范德比尔特搬到约翰·霍普金斯大学时的工作，该机构唯一的黑人雇员是看门人，托马斯必须从后门进入。他们共同治疗法洛四联症（也称为蓝婴综合症）的先天性心脏缺陷，从而开辟了心脏外科领域。
约翰·霍普金斯大学的儿科医生/心脏病专家海伦·陶西格（玛丽·斯图尔特·马斯特森饰）向布莱洛克发起挑战，要求她为她的蓝色婴儿提出手术解决方案。她需要一个新的导管来为血液充氧。
两人用从当地狗收容所养来的流浪狗进行实验，故意给这些狗带来心脏缺陷，并试图解决它。结果看起来不错，他们很高兴能对有缺陷的婴儿进行手术，但在梦中，托马斯看到婴儿长大了，因为她快死了而哭泣。托马斯问她为什么会在梦中死去，她说因为她有一颗幼小的心脏。布莱洛克将其解释为这样一个事实：他们的缝纫技术不起作用，因为缝线不随心脏生长，因此开发了一种可行的新版本。
这部电影戏剧化地讲述了布莱洛克和托马斯为拯救垂死的蓝宝宝而进行的战斗。布莱洛克称赞托马斯的手术技巧“就像上帝创造的东西”，并坚持托马斯不顾霍普金斯大学管理人员的抗议，指导他完成了第一次蓝色婴儿手术。然而在实验室之外，他们却被当时盛行的种族主义所隔离。布莱洛克曾经犯过一次错误，不小心在错误的地方切断了动脉，但最终和托马斯一起成功了。随着他们成功的消息很快传开，全国各地的父母带着生病的孩子涌入医院，希望手术能够治愈他们。来自世界各地的医生也开始参加托马斯的手术，以学习如何自己进行手术，以便他们能够治疗自己的患者。托马斯以调酒师的身份参加布莱洛克的派对，兼职赚取额外收入，当布莱洛克因在隔离的丽城酒店的蓝色婴儿工作而受到表彰时，托马斯并不在受邀客人之列。相反，他从舞厅后面的盆栽棕榈树后面观看。从那里，他听到布莱洛克赞扬了协助这项工作的其他医生，但没有提及托马斯或他的贡献。第二天，托马斯透露他看到了仪式，并退出了实验室。然而，他的心却放在了他留下的工作上，以至于他在其他方面的努力并不快乐。因此，他决定忽略布莱洛克的不承认并返回实验室。托马斯不在受邀嘉宾之列。相反，他从舞厅后面的盆栽棕榈树后面观看。从那里，他听到布莱洛克赞扬了协助这项工作的其他医生，但没有提及托马斯或他的贡献。第二天，托马斯透露他看到了仪式，并退出了实验室。然而，他的心却放在了他留下的工作上，以至于他在其他方面的努力并不快乐。因此，他决定忽略布莱洛克的不承认并返回实验室。托马斯不在受邀嘉宾之列。相反，他从舞厅后面的盆栽棕榈树后面观看。从那里，他听到布莱洛克赞扬了协助这项工作的其他医生，但没有提及托马斯或他的贡献。第二天，托马斯透露他看到了仪式，并退出了实验室。然而，他的心却放在了他留下的工作上，以至于他在其他方面的努力并不快乐。因此，他决定忽略布莱洛克的不承认并返回实验室。他的心全在他留下的工作上，以至于他对其他的努力感到不高兴。因此，他决定忽略布莱洛克的不承认并返回实验室。他的心全在他留下的工作上，以至于他对其他的努力感到不高兴。因此，他决定忽略布莱洛克的不承认并返回实验室。
1964 年，布莱洛克去世前一天，他见到了托马斯，托马斯现在是一名专业外科医生和心脏直视手术室的培训师。布莱洛克去世后，托马斯继续在约翰霍普金斯大学培训外科医生。影片结束时，在 1976 年的正式仪式上，霍普金斯认可了托马斯的工作，并授予他荣誉博士学位。约翰·霍普金斯大学的墙上挂着托马斯的肖像，旁边是几年前挂在那里的布莱洛克的肖像。一段简短的蒙太奇显示“DR.” 《阿尔弗雷德·布莱洛克 1899-1964》在布莱洛克的肖像上方，以及《阿尔弗雷德·布莱洛克 1899-1964》。费雯·托马斯：1910-1985' 超过托马斯。
